De retour sur l'île avec ses dinosaures asservis, M. Kondo est prêt à tout pour  en récupérer le contrôle ! Mais les enfants tout comme les dinosaures encore libres n'ont pas l'intention de le laisser faire... tandis que Kenji, lui, a enfin ouvert les yeux sur son père. Dinosaures contre dinosaures, adolescents contre multinationale, la lutte finale s'annonce terrible et sans merci...